舟山保税港区根据业务的类型将港区分为舟山海洋科学城（钓梁区块）、衢山岛、岱山大长涂岛三个区块。舟山海洋科学城（钓梁区块）港口功能定位为：保税仓储、开展国际转口贸易产业，产业定位：海洋工程和船舶、水产加工业、海洋新能源产业及相关新兴海洋产业。